×

个人简介



image.png

  • 性别:女
  • 职称:副研究员
  • 学历:博士
  • 学科:
个人简历

华南师范大学生命科学学院副研究员,硕导。西安交通大学学士,新加坡国立大学博士、博士后。从事环境与人体微生物组研究,应用多组学技术与微生物学手段探究微生物抗生素耐药基因的环境过程与传播机制。以通讯或第一作者在Nature Medicine,Nature Microbiology,Nature Communications, ISME Journal等期刊发表SCI论文20余篇,H-index为16。主持国自然面上项目、青年项目、广东省自然面上项目等。


研究方向
抗生素耐药性(AMR)是全球公共卫生面临的重大威胁,而环境(如土壤、空气、水体)作为ARGs的重要储存库和传播枢纽,其向人体微生物组(尤其是呼吸道、肠道等)的迁移是耐药性传播的关键路径,具体过程与驱动机制尚待阐明。 我们整合运用宏基因组学、宏转录组学、宏代谢组学等前沿多组学技术,结合传统微生物培养分离、分子生物学及生物信息学手段,系统性地研究环境与人体微生物组的交互作用研究,特别聚焦于采矿活动影响下微生物抗生素耐药基因(ARGs)的环境富集、传播机制及其向人体微生物组的迁移风险: 1.环境过程解析: 追踪ARGs在不同环境介质(如矿山及周边陆地生境)中的分布特征、动态变化规律及其驱动因子(如污染物暴露、环境压力)。 2.传播机制探索: 揭示ARGs在环境微生物群落内部,以及从环境微生物到人体共生/病原微生物(特别是关键病原菌)之间的水平基因转移(HGT)机制与关键媒介(如可移动遗传元件MGEs)。 3.界面迁移研究: 探究ARGs在“环境-人体”界面(如通过食物链、粉尘吸入等途径)的迁移定植规律及其对人体微生物组耐药基因谱的影响。
讲授课程
生物信息学,本科生,选修 生物信息与组学,研究生,必修课,参与
承担课题
1.国家自然科学基金面上项目,《微生物抗生素耐药基因在矿山-农田-人体中的传播风险及机制研究》,50万元,32470094,2025.01 – 2028.12(在研,主持) 2.广东省自然科学基金面上项目,《矿山环境抗生素抗性基因在环境-人体中的传播风险及潜在机制》,10万元,2023A1515012367,2023.01 – 2025.12(在研,主持) 3.国家自然科学基金青年项目,《酸性矿山废水底泥中微生物耐药性基因持久性机理的研究》,26万元,41907211,2020. 01 – 2022.12(已结题,主持)
论文专著

论文专著(1第一作者,# 通讯作者):

1. Globally distributed mining-impacted environments are underexplored hotspots of multidrug resistance genes. Yi X1, Liang JL1, Su JQ, Jia P, Lu JL, Zheng J, Wang Z, Feng SW, Luo ZH, Ai HX, Liao B, Shu WS, Li JT# and Zhu YG. The ISME Journal (2022) 16: 2099-2113.ESI高被引论文

2. Giant viruses as reservoirs of antibiotic resistance genes. Yi X1, Liang JL1, Wen P, Jia P, Feng WS, Liu SY, Zhuang YY, Guo YQ, Lu JL, Zhong SJ, Liao B, Wang Z, Shu WS and Li JT#. Nature Communications (2024) 15: 7536.入选期刊Editors Highlights文章

3. The airway microbiome mediates the interaction between environmental exposure and respiratory health in humans. Lin L1, Yi X1, Liu H1, Meng R1, Li S, Liu X, Yang J, Xu Y, Li C, Wang Y, Xiao N, Li H, Liu Z, Xiang Z, Shu WS, Guan WJ#, Zheng XY#, Sun JF# and Wang Z#. Nature Medicine (2023) 29: 1750-1759.入选2023年中国传染领域十大进展

4. Multi-omics analyses of airway host–microbe interactions in chronic obstructive pulmonary disease identify potential therapeutic interventions. Yan Z1, Chen BX1, Yang YQ1, Yi X1, Wei MY1, Ecklu-Mensah G, Buschmann MM, Liu H, Gao J, Liang W, Liu X, Yang J, Ma W, Liang Z, Wang F, Chen D, Wang L, Shi W, Stampfli MR, Li P, Gong S, Chen X, Shu WS, EI-Omar EM, Gilbert JA, Blaser MJ, Zhou H#, Chen R# and Wang Z#. Nature Microbiology (2022) 7: 1361-1375.ESI高被引论文

5. The human lung microbiome—a hidden link between microbes and human health and diseases. Yi X, Gao J and Wang Z#. iMeta (2022) e33.

近三年其它论文

1. Phytostabilization mitigates antibiotic resistance gene enrichment in a copper mine tailings pond. Yi X1, Wen P1, Liang JL, Jia P, Yang TT, Feng SW, Liao B, Shu WS and Li JT#. Journal of Hazardous Materials (2023) 443: 130255.

2. Environmental exposure, airway microbiome and respiratory health: You are what you breathe. Yi X, Cai H, Gao J, Wang Z#. Clinical and Translational Medicine (2023) 13(9): e1394.

3. Differential airway resistome and its correlations with clinical characteristics in Haemophilus- or Pseudomonas-predominant microbial subtypes of bronchiectasis. Yi X1, Yang JH1, Huang Y1, Han XR1, Li HM1, Cen LJ, Lin ZH, Pan CX, Wang Z#, and Guan WJ#. Respiratory Research (2023) 24, 264.

4. Characteristics of upper and lower respiratory tract microbiota after lung transplantation. Cai Y, Fan Y, Chen A, Wang X, Wang L, Chen J, Wang Z, Li J#, Yi X# and Ju C#. Respiratory Research (2025) 26(1): 160.

5. Inflammatory endotype-associated airway resistome in chronic obstructive pulmonary disease. Yi X1, Li Y1, Liu HY1, Liu X, Yang J, Gao J, Yang Y, Liang Z, Wang F, Chen D, Wang L, Shi W, Lam DCL, Stampfli MR, Paul WJ, Chen R# and Wang Z#. Microbiology Spectrum (2022) 10(2): e02593-02521.

6. Sputum microbiota compositions correlate with metabolome and clinical outcomes of COPD-bronchiectasis association: a prospective cohort study. He ZF1, Zhang XX1, Pan CX1, Yi X1, Huang Y, Chen CL, Zha SS, Cen LJ, Cai HQ, Yang L, Gao JQ, Li HM, Lin ZH, Lin SZ, Wang Z#, Zhong NS#, Guan WJ#. Exploration (2025) 20240149.

 


  • 页面导航
  • 基本信息
  • 个人简历
  • 研究方向
  • 讲授课程
  • 承担课题
  • 论文专著
  • 返回顶部