本课程是生物学类专业的核心专业基础课，在国内外生物专业均有开设。本课程在长期的教学过程中，充分发挥网络环境下学习的优势，经过多年的实践与积累，建立了大量的微生物学优秀教学资源，研制微生物学多媒体课件、网络课程，获国家三等奖，出版了微生物学多媒体教学软件（网络版）（电子教材）和微生物学实验指导（教材）；开发了多媒体、网络化的微生物学课程教学网站；建立了微生物学精品课程网站、网络教学平台、微生物学教学论坛、微生物学专题资源库以及古生菌专题资源、食用菌专题资源网。网络教学资源处于全国同类课程领先位置。
本课程的教学手段、教学方法在国内同类课程中领先。本课程在现代教育技术理论的指导下，采用行动研究方法，开展微生物学网络教学试验研究，通过多轮的行动研究与实践，探索形成基于问题的探究型网络教学模式，该模式充分发挥网络环境下学习的优势，将学习内容问题化、学习过程探究化、学习活动网络化，使学生的主体性得以实现。课程的教学效果显著，培养了学生的自主学习、探究学习、协作学习和创新学习能力。
加强教材建设，《微生物学多媒体教学软件（网络版）》由高等教育出版社出版（张松主编，2006）；《微生物学实验指导》由暨南大学出版社出版（黄文芳、张松主编，2003）。教材已在国内多所院校使用，在全国同类专业中产生了较大的影响。
改革实验内容，进行探究性实验。独立开设实验课，创立实验的“多元学习法”，即通过微生物学基础实验、综合设计实验和学生课外科研项目，自主完成从选题、实验操作到撰写论文等环节，培养了学生实验操作能力。综合班学生的实验是根据不同的专题，将单独实验，设计成一个带有探究性大实验，从取样、制备培养基、菌种分离纯化、培养、形态观察、生理生化实验、生长曲线的测定、微生物分子生物学、种属的定位都由学生独立完成，每位学生都能写出具有自己特色的实验课程论文，实现了微生物实验教学从验证性实验到探究性实验的转变，培养了学生的创新能力，指导的学生多次在院、校和省级“挑战杯”大学生课外科研作品竞赛中获得奖励。实验改革在全国具有较大的影响。
以我院生物学基础课省级实验教学示范中心为依托，加强微生物发酵实验室和实验基地的建设，建立形成生物工程发酵工艺实验室，成为学生教学实习基地，在全国产生了很大的影响，多次接受其它院校（如武汉工业大学、广州大学、湖南科技大学、新疆师范大学、成都理工大学、安徽农业大学等）任课教师和访问学者，在微生物发酵、网络课程、课程教改，师资培养等方面提供支持和帮助，为兄弟院校培养人才。同时成为广州大学、广州教育学院等院校的专业实习基地。微生物学实验室还接受普通高中生物新课程“生物技术实践”的教师培训，为广东省培养了大批高中生物骨干教师。